雅各布的父亲曾是一艘私人护卫舰的大副，该舰10年前在星际旅行时失踪，但几个星期前有人收到这艘飞船发出的紧急求救信号，雅各布想弄清楚这到底是怎么一回事。跃迁到罗塞塔星云（Rosetta Nebula）后，找到首龙星系（Alpha Draconis System）的2175号艾厄行星（2175Aeia），通过扫描发现任务地点后登陆。

在海滩边发现星舰残骸，与人工智能交谈得知，10年前星道降此行星时船长不幸身亡，雅各布的父亲接任船长，当地食物中含有一种毒素可使人逐渐遗忘过去的记忆。往前走遇到一名语无伦次的女船员，她身后有一帮武装男子追杀。消灭暴徒后，来到村落中发现这里只有女人，与村口女医生交谈了解到雅各布的父亲在飞船坠毁后实施口粮管制，仅有军官可享用舰上的剩余口粮，普通船员只能吃当地食物，等援救到来后再设法治愈船员们的失忆症。由于维修信号发射器时间过长，加上毒素对男性的暴力催化作用，男性船员们发动哗变，雅各布的父亲利用战斗机器人严惩任何敢于违令的船员。之后事态逐渐失控，女船员被当作奖品赏配给军官，军官内部也开始发生争斗。

薛帕德攻入机器人驻守的营地后终于找到雅各布的父亲，他本想装出一副无辜相，但在儿子的质问下这位父亲只能承认他处决了大部分军官和船员，由于害怕自已所做的一切被外界得知，因此修好发射器后也不敢向外发送求救信号。

雅各布怒斥已变得毫无人性的父亲，此时薛帕德可选择将其处决或交给法庭。

返回诺曼底号后雅各布找到幻象人质问到底是谁发送了求救信号，米兰达站出来声称对此事负责，因为雅各布一直惦记着失踪的父亲，米兰达希望满足他的这个心愿。

米兰达：漂泊者

米兰达在谈话中会提到自己离家出走的经历，她那位有钱的父亲利用克隆技术创造了米兰达，并对她实施大量基因改良手术，目的是想打造一位完美的产业继承人，厌恶这种生活的米兰达选择了逃跑。但是米兰达的父亲还培养了一个她的双胞胎妹妹欧芮娜（Oriana）作为后备接班人，米兰达逃跑时带走妹妹并将她秘密寄养在一对不知情的夫妇家中，最近米兰达的父亲似乎发现了欧芮娜的下落，米兰达想要尽快转移妹妹一家。

薛帕德答应帮忙后再次前往招募审判者萨玛拉和刺客塞恩的伊利姆行星，带着米兰达到地图东北角的永恒酒吧（EternityBar）见到联络人兰提（Lantiea），从她那里得知月蚀佣兵团正在监视米兰达，米兰达的朋友尼克（Nket）自愿护送欧芮娜一家前往空港远走高飞。

果然一帮月蚀佣兵将薛帕德和米兰达堵在港口货场，佣兵们似乎已经知道米兰达和尼克的计划，经过多场战斗后找到和月蚀佣兵头目在一起的尼克。尼克误认为米兰达带走欧芮娜是为了报复父亲，因此私自找来月蚀佣兵想让父女团聚。

执行善意中断阻止米兰达向尼克开枪，但尼克仍死于月蚀佣兵头目之手。消灭所有月蚀佣兵后到空港为欧芮娜一家送行，薛帕德可以鼓励米兰达上前与妹妹道别。

杰克：零号目标

杰克是“地狱犬”从幼年时期就封闭培养的顶级超能者，囚徒般的生活在她心底留下了难以磨灭的阴影，虽然成功逃出牢笼，但杰克却希望重回故地摧毁那座带给自己无穷噩梦的儿童培训基地。跃迁到努比亚星域（NubianExpanse），在达卡恒星系（Dakka）的普拉吉行星（Pragia）着陆，进人破败不堪的基地后通过沿途发现的视频记录和杰克的回忆了解到当年的情况。

战斗中发现这里除了瓦伦兽外居然还有血袋佣兵团的人，消灭所有佣兵后找到一位名叫艾瑞西（Aresh）的男子，原来他也是昔日接受培训的幼童之一。

艾瑞西带血袋佣兵团来这里是想继续研究人体生化超能，他还拐来了不少儿童。愤怒的杰克举枪瞄准了艾瑞西，这里可选择说服杰克不要再杀人。

赶走艾瑞西后，薛帕德可以陪杰克看看她的房间追忆当年

登上运输船离开途中杰克会按下遥控炸药起爆钮

将自己不堪回首的过去化作一团火云。

完成杰克的忠诚度任务后，返回诺曼底号上会发生米兰达和杰克吵架事件，善意值或叛逆值全满才能不伤和气地劝开，否则只能选择偏相一方，另一方将拒绝再与薛帕德谈话并且无法达成忠诚状态，此后只能等待积满善意值或叛逆值才能劝这位队友回心转意。

莫丁：资深高徒

莫丁教授有位学生梅伦（Maelon）曾参加过对克罗根绝育症的研究工作，但最近他在克罗根人的母星被血袋佣兵团绑架，莫丁希望尽快救回自己的学生。

跃迁到克罗根非军事区（KroganDMZ），登陆艾拉勒克恒星系（Aralakh）的图强卡行星（Tuchanka）。着陆平台的克罗根卫队长要求薛帕德立刻去见部族酋长，在废墟村落人口处找到石头王座上的酋长雷夫（Wreav），询问是否知道被俘获的萨拉瑞恩人下落。

雷夫让薛帕德去找村中厅候问问，斥候透露血袋佣兵团曾将一名俘获的萨拉瑞恩人押往与本部族敌对的维罗克部族（ClanWeyrloc）。对话中选择搭乘卡车赶到维罗克部族，进入废弃医院大楼后发现一具死于活体实验的人类尸体。

再往前走遇上维罗克部族首长，这个狂妄的家伙声称要让梅伦治愈克罗根绝育症，之后他将开始征服整个宇宙，在他大吹法螺时可执行叛逆中断动作射爆其脚下的燃料罐。

消灭酋长后在后面牢房中找到一名被因禁的克罗根斥候，这位斥候表示愿意为治疗绝育症献出自己的生命，放任自流或说服他离开。

在大楼底层实验室中找到梅伦，这位莫丁教授的高徒原来并没有被绑架，他自愿来协助克罗根人研究治愈绝育症的良方，但其滥用活体生物的残忍作法激怒了莫丁教授。曾当过萨拉瑞恩特种兵的教授举枪要杀自己的学生，此时薛帕德可选择善意中断或坐看教授杀死学生，最后还可以建议教授是否留下梅伦的研究成果。

格朗特：试炼仪式

住在诺曼底号底层货仓中的格朗特突然感到一阵没来由的烦躁，脑海中不断涌出无数先辈战斗厮杀的画面，他认为自己病了，需要到克罗根人的母星图强卡寻找疗方。莫丁教授的忠诚度任务完成后，再次找到酋长雷夫求助，雷夫称格朗特需要通过传统克罗根人的试炼仪式才能洗涤内心焦躁。

由于格朗特是无部族的试管婴儿，雷夫表示愿意接纳他加入自己的部族，旁边的二当家乌文克（Uvenk）立刻反对，雷夫让格朗特去找部族萨满接受试炼，乌文克骂骂咧咧恨恨而去。在旁边楼上找到萨满，薛帕德和另一名队友陪伴格朗特开始了试炼生存作战。

三人被送到一处平台广场迎战三波未知之敌，每波结束后按身后的匙石按钮即可召唤下一波攻击。第一波是瓦伦兽的集群冲锋，推荐用弹枪跑动作战；第二波是飞龙轰炸加地面幼龙突击，天上的飞龙打不到，应付好地面扑来的幼龙即可；第三波是一只巨大的钻地甲虫，它会随机出现在不同方向并发射致命毒液炸弹，这种炸弹能破坏障碍物和石质平台，薛帕德可用导弹发射器和狙击枪干掉甲虫怪，或撑满5分钟都算通过测试。